کلیسای نیکوغایوس مقدس واقع در محله قاراگل در سال 1630م بنا شده است. کلیسا با پلانی مستطیل شکل در جهت شرقی-غربی قرار گرفته و سقف و گنبد آن بر ستون های پهن متصل به دیوارهای جانبی تکیه کرده است. این ستون ها فضای داخلی کلیسا را به سه بخش مرتبط با یکدیگر تقسیم کرده اند. گنبد اصلی کلیسا با هشت نورگیر در بالای بخش میانی قرار گرفته. برج ناقوس نیز در بخش غربی و بر روی سقف بنا واقع شده. در بخش شرقی نیز محراب با دو اتاقک چهارگوش در دو سوی آن قرار گرفته است.
مصالح به کار رفته در ساختمان عبارتند از خشت و آجر. دیوارهای داخلی بنا با گچ پوشانده و در برخی قسمت ها با خطوط هندسی تزیین شده اند. در سمت شمال شرقی کلیسا، نمازخانه استپانوس مقدس واقع شده که در سال 1774م ساخته شده است. در حیاط کلیسا نیز مدفن خواجه میناس قرار دارد که به دستور نادرشاه کشته شد.